要避免寶寶日後為過敏所苦，從懷孕、出生，到兩歲之前，這段寶寶生命最初的1000天當中，應給予其適當的飲食和營養，才能為寶寶未來的免疫力發展打好基礎。
對寶寶來說最好的預防過敏方式就是母乳，因為母乳含有許多抗體及具有保護力的成分，像是抗菌蛋白、免疫球蛋白等，能幫助寶寶增強抵抗力，培育健康體質。因此建議媽媽盡可能哺餵母乳。
然而，若母親因為外在因素而不方便繼續哺育母乳時，眾多配方奶品項應如何選擇，才能繼續提供足夠的保護力?中山醫學大學附設醫院小兒過敏免疫科主任孫海倫小兒科醫師表示，建議可以選擇水解蛋白配方奶粉來銜接母乳，因為一般配方奶蛋白質分子過大，容易刺激寶寶腸道引發過敏症狀，而水解蛋白配方奶粉利用特殊的水解技術，將蛋白質從大分子切成小分子，讓寶寶更容易吸收，不容易刺激腸道。
一般媽媽對部分水解蛋白配方營養不足的迷思，醫師舉例說明，「就像把一千塊換成兩張五百塊，它的營養價值還是跟一千塊一樣!」;此外，在一項研究報告中也顯示，喝水解配方奶粉的寶寶，其體重和頭圍和使用一般配方奶粉的寶寶並無差異。
